| 序号 | 项 目 名 称 | 计划类别 | 项目编号 | 主持人 | 总经费 | 当年到位 | 备注 |
| （万元） | （万元） |
| 1 | 纵向岭谷区生态系统变化及西南跨境生态安全 | 973 | 2003CB415100 | 何大明 | 2290 | 800 |
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| 2 | 云南高原杀虫菌物物种多样性及应用价值评估 | 973前期 | 2002CCC02800 | 张克勤 | 50 | 25 |
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| 3 | 多功能(解磷、解钾)基因工程菌的构建及应用 | 863 | 2002AA213061 | 张克勤 | 90 | 30 | 副组长 |
| 4 | 云南具有疾病相关表型隔离人群遗传资源的 收集和研究 | 863 | 2001AA 22C041 | 肖春杰 | 60 | 15 | 第二主持 |
| 5 | 线虫生防制剂规模化生产关键技术开发 | 国家攻关 | 2002BA 901A21 | 张克勤 | 180 | 80 |
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| 6 | 澜沦江流域跨境水资源的整体分配研究 | 国家攻关 | 2002BA 901A22 | 何大明 | 150 | 50 |
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| 7 | 云南少数民族基因资源与区域健康安全研究 | 国家攻关 | 2004BA 901A07 | 肖春杰 | 230 | 140 |
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| 8 | 线虫生防制剂高技术产业化示范工程 | 高技术示范 |
| 张克勤 | 总7100 研费1400 | 300 |
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| 9 | 酒精工业高效发酵生产新技术成果转化 | 财政部专项 |
| 张克勤 | 200 | 100 |
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| 10 | 微生物种质资源库收集保存的前期研究 | 科技部基础 | 2001DEA10009 | 张克勤 | 150 | 12 | 专项负责 |
| 11 | 重要野生食用菌菌种资源收集与保藏研究 | 科技部基础 |
| 赵之伟 | 50 | 8 |
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| 12 | 利用云南少数民族遗传资源开展高血压病相关基因研究 | 国基重点 | 30269001 | 肖春杰 | 80 | 30 |
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| 13 | 中国西北微生物资源、分类与分子系统学研究 | 国基重点 | 30230020 | 张克勤 | 150 | 20 | 参加 |
| 14 | 动物适应进化的遗传机制 | 国基重点 | 304301113 | 张亚平 | 140 |
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| 15 | 中泰8个人群的Y-DNA遗传多样性分析 | 国基面上 | 30160037 | 肖春杰 | 19 | 6 |
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| 16 | 云南几种典型水系中水生真菌生物多样性研究 | 国基面上 | 30260002 | 蔡磊 | 25 | 10 |
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| 17 | 捕食线虫真菌捕食器官基因克隆 | 国基面上 | 30160004 | 莫明和 | 21 | 8.4 |
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| 18 | 金沙江干热河谷中的丛枝菌根真菌与植被恢复基础研究 | 国基面上 | 30360003 | 赵之伟 | 20 | 8 |
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| 19 | 微生物发酵三七的抗菌活性成份研究 | 国基面上 | 20362010 | 刘亚君 | 7 | 7 |
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| 20 | 稀有放线菌的系统分类 | 国基面上 | 30270004 | 徐丽华 | 20 | 8 |
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| 21 | 应用rRNA法研究云南腾冲热海热泉的微生物多样性 | 国基面上 | 32260004 | 崔小龙 | 20 | 8 |
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| 22 | 不同地热区高温丝状菌席种群组成和群落结构的研究 | 国基面上 | 30360004 | 彭谦 | 20 | 7 |
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| 23 | 二株放线菌一氧化氮合酶抑制成分研究 | 国基面上 | 20362009 | 文孟良 | 13 | 8 |
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| 24 | 大型水电梯级工程建设对地方经济和生态的综合影响 | 国基面上 | 40161010 | 陈丽晖 | 20 | 6 |
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| 25 | 元江-红河水资源系统变化整体生态评价和合理利用研究 | 国基面上 | 40261001 | 何大明 | 25 | 10 |
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| 26 | 植物在污染条件下种群衰退的分子生态预警 | 国基面上 | 30270284 | 段昌群 | 20 | 8 |
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| 27 | 毛头鬼伞杀线虫的机理研究 | 国基面上 | 30470067 | 张克勤 | 25 |
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| 28 | 抑菌土壤中细菌组成的分子分析及抑蛋白研究 | 国基面上 | 30460078 | 莫明和 | 20 |
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| 29 | 云南3个古老岩盐沉积中的原核生物多样性研究 | 国基面上 | 30460004 | 崔晓龙 | 20 |
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| 30 | 三株高盐环境新属放线（细）菌次生代谢产物研究 | 国基面上 | 3040022 | 李铭刚 | 20 |
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| 31 | 三株嗜碱放线菌抗肿瘤活性成分研究 | 国基面上 | 20462008 | 李一青 | 20 |
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| 32 | 中国果蝇属暗果蝇种组的系统发育 | 国基面上 | 30460026 | 高建军 | 7 |
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| 33 | 一非综合征混合型多指(趾)畸形家系致病基因的定位 | 国基面上 | 30460057 | 程宝文 | 21 |
| 肖春杰 |
| 34 | 云南高原国际水道跨境资源环境研究 | 教育部重点 | 2144 | 何大明 | 21 | 10 |
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| 35 | 重金属抗性植物的综合抗逆性及其污染区生态恢复植物的遴选技术路线研究 | 教育部骨干 | GG-180-10673-2001 | 段昌群 | 12 | 6 |
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| 36 | 酵母热休克转录因子在全基因组上的定位与功能分析 | 教育部留学 |
| 张乐民 | 3 | 3 |
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| 37 | 云南国际河流水资源合理利用与生态环境保护整体 | 国际合作 | 2001D0002Z | 何大明 | 50 | 10 |
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| 38 | Linking Trade, Ecosystems, and Povertyin Southern Yunnan, China | 国际合作 | WWF & WB | 何大明 | US：15 120 | 50 |
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| 39 | International Symposium on Transboundary Water and Ecological Security | 国际合作 | UN Uinversity | 何大明 | US：2.1 20 | 20 |
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| 40 | 中德共建天然产物联合实验室 | 国际合作 |
| 文孟良 | 20 | 6 |
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| 41 | 微胶囊农药规模化生产的关键技术 | 省攻关 | 2001NG33 | 张克勤 | 90 | 30 | 共同主持 |
| 42 | 造纸工业用酶制剂的开发与应用 | 省攻关 | 2001GG24 | 李文鹏 | 90 | 60 |
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| 43 | 非典型肺炎(SARS)病毒的源流及基因组变化规律 | 省应基重点 | 2003C0001Z | 张亚平 | 80 | 80 |
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| 44 | 土壤抑菌作用机理与解除土壤对生防菌抑菌作用研究 | 省应基重点 | 2001C0012Z | 张克勤 | 50 | 20 |
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| 45 | 丛枝菌根真菌与干热河谷退化生态系统修复与重建研究 | 省应基重点 | 2001C0001Z | 赵之伟 | 50 | 10 |
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| 46 | 主要畜禽经济性状基因的克隆与基因多样性研究 | 省应基重点 | 2003C0011Z | 张亚平 | 50 | 20 |
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| 47 | 云南省国际河流水资源公平合理利用和生态环境保护整体研究 | 省应基重点 | 2001D002Z | 何大明 | 50 | 10 |
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| 48 | 云南高原的演变与资源环境效应 | 主任基金 | 2002d0001R | 何大明 | 30 | 30 |
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| 49 | 云南无公害蔬菜评价体系与控制机理研究 | 省应基重点 | 2002C0001Z | 段昌群 | 50 | 20 |
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| 50 | 云南主要公路沿线生态环境评估 | 省应基重点 | 2003C0002Z | 甘淑 | 40 | 15 |
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| 51 | 侵染线虫机制相关酶的基因克隆和功能研究 | 省应基重点 | 2004C0001Z | 张克勤 | 55 | 20 |
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| 52 | 微生物杀植物病原真菌制剂的应用研究 | 省应基重点 | 2004C0002Z | 文孟良 | 60 | 20 |
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| 53 | 新型植酸酶工程菌肥研制与应用 | 省院省校 | 2001GBBFA02H019 | 张克勤 | 50 | 5 | 合作 |
| 54 | 三七根腐病综合治理技术研究 | 省院省校 | 2001ZCBFB 01C | 张克勤 | 200 | 5 | 合作 |
| 55 | 共建云南大学生物学一级学科 | 省院省校 |
| 张克勤 | 110 | 20 |
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| 56 | 微生物来源的重金属吸附剂的研究 | 省基金 | 2002C000IQ | 张汉波 | 5 | 2 |
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| 57 | 云南鲤属鱼类的分子进化与保护遗传学研究 | 省基金 | 2002C0002Q | 郑冰蓉 | 5 | 2 |
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| 58 | 酵母热休克因子在基因组上的定位与功能分析 | 主任基金 | 2003C0012R | 张乐民 | 7.5 | 4.5 |
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| 59 | 云南鲤属鱼类的分子进化与保护遗传学研究 | 省基金 | 2002C0002Q | 郑冰蓉 | 5 |
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| 60 | 微生物来源的重金属吸附剂的研究 | 省基金 | 2002C000IQ | 张汉波 | 5 |
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| 61 | 三株杀粘虫放线菌有效成分的研究 | 省基金 | 2003C 0008M | 吴少华 | 5.5 | 3.3 |
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| 62 | 灰狼的起源和进化研究 | 省基金 |
| 沙涛 | 7 | 7 |
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| 63 | 食线虫真菌碱性蛋白酶cDNA基因异源高效表达 | 省基金 | 2003C0003Q | 黄晓玮 | 7 | 4 |
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| 64 | 利用RRNA基因的寡核苷酸接线员纹技术研究抑菌土壤中菌的种类组成 | 省基金 | 2004C0001Q | 莫明和 | 5 |
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| 65 | 粉红螺旋聚孢霉侵染线虫的胞外蛋白酶基因克隆与功能分析 | 人才项目 |
| 莫明和 | 16 | 8 |
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| 66 | 侧孢芽孢杆菌侵染线虫分子机制中相关胞外蛋白酶的研究 | 省基金 | 2004C0004Q | 黄晓玮 | 5 |
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| 67 | 两种食用菌的杀线虫活性研究 | 省基金 | 2004C0003Q | 李国红 | 5 |
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| 68 | 放线菌资源与分类 | 人才项目 |
| 李文均 | 16 | 8 |
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| 69 | 产生先导化合物放线菌的研究 | 横向 |
| 姜成林 | 60 | 30 | 华北制药 |
| 70 | 药用真菌开发研究 | 横向 |
| 陈有为 | 30 | 15 | 华北制药 |
| 合计：合同经费7068万元；2004年度到位经费2252.8万元 |
