研究系统分析了元阳梯田稻瘟病菌的遗传多样性,结果表明元阳稻瘟病菌群体的遗传结构与籼粳型寄主的相关性很强,可清晰划分为籼型菌株和粳型菌株。从粳稻上分离到粳型菌株的比例占92%,从籼稻上分离到籼型菌株占94%。无毒基因的检测结果表明,粳型菌株中平均含有 12 个无毒基因,而籼型菌株中平均仅含有8 个无毒基因。其中主要差异的无毒基因为 AVR-Pia、AVR-Pita1、AVR-Pik、AVR-Piks 和AVR-Pi3。元阳主栽水稻品种抗病基因的检测结果表明,籼稻中抗病基因数目显著多于粳稻,主要的差异抗病基因为 Pia、Pi9、Pid3、Pib 和 Pi5。致病性测定结果表明,效应子越多的菌株对元阳粳稻的致病性越强,因而对粳稻有较强的适应性。进一步分析元阳粳稻的基础抗性和部分抗性水平发现,粳稻黄皮糯和糯谷的组成型抗性水平和几丁质诱导的抗性水平显著高于日本晴(部分抗性水平为中等),其部分抗性水平也显著高于当地的籼稻品种月亮谷和小谷。因此在元阳梯田的水稻中,籼稻品种主要依靠较多的垂直抗病基因,而粳稻则靠基础抗性和部分抗性维持了其在梯田中的持续利用。该研究成果2016年发表在eLife。
元阳梯田的地方水稻品种的对当地稻瘟病菌毒力的适应性